腐植酸的组成和性质，决定了其在环境保护方面具有广阔的应用前景。
由于腐植酸类物质的分子结构中含有醌基、半醌基等官能团，可与硫化氢反应，用作废气的脱硫剂。腐植酸及其盐类可用做原子能分裂产物的吸附剂、放射性废水处理的凝聚剂以及处理放射性废物和废水中同位素、稀有元素的吸附剂。腐植酸内表面积大，又含有羧基和酚羟基，这些基团可与重金属离子进行交换、络合和螯合等作用。因此，可以利用腐植酸处理含重金属的工业废水、含油废水、印染废水和废气等。
早在20世纪70年代，东北师范大学、上海化工学院、中国科学院地理所和土壤所等单位，利用腐植酸类物质吸附工业废水中重金属离子，吸附率较活性炭高一至数倍，对汞、铅、铜、镉、锌等重金属离子的吸附量可达90%～98%。腐植酸类物质对含Cr6+的废水也有很好的吸附效果。
