含氧官能团 腐植酸中主要含氧官能团是羰基、酚羟基、醇羟基、羧基、烷氧基、醌基等，不同类型腐植酸中，含氧官能团变化规律不明显。这些官能团在以下光谱分析中有所体现，如电子自旋共振光谱（ESR）表明腐殖酸中有醌基和半醌；傅里叶变换红外光谱（FTIR）揭示腐植酸中有羰基、酚羟基、醇羟基、羧基、烷氧基、芳烃等；紫外吸收光谱中，在210nm邻近有一个来自芳香结构的吸收峰；三维荧光光谱能够获得腐植酸中荧光基团完整的光谱信息。
E4/E6关于其含义，有不同的说法。目前多数学者认为与芳香化程度或羰基共轭度有关。测定时采用0.05mol碳酸氢钠作溶剂，在一定浓度范围内（40～200mg/kg），在可见分光光度计上对比465nm（E4）和665nm（E6）吸光度。
国内外对不同来源腐植酸的表征结果表明，其结构和组成存在差异，这与腐植酸的来源、产地和提取方法等相关。